在3月31日于首波上市国家开放销售的iPhone SE，稍早已经由iFixit、ChipWorks等网站完成拆解，其中发现有不少零件确实与iPhone 5s共用，例如采用相同萤幕面板模组、维持使用Toshiba提供NAND Flash储存元件，同时机身框体也大致相同。不过，iPhone SE采用较大的电池容量，同时内部电池接点、相机模组设计均不同，因此无法直接与iPhone 5s互换使用。
根据iFixit、ChipWorks等网站完成iPhone SE拆解报导内容，显示此款新机在不少细节仍与iPhone 5s相同，例如均采用相同萤幕面板模组、相同的Toshiba NAND Flash储存元件，同时金属机身框体也几乎完全相同。
不过，iPhone SE可能因为相机功能与加入NFC感应功能，因此电池容量采用1624mAh设计，相比iPhone 5s采用1560mAh容量设计稍大一些。但因为电池接点设计不同，因此iPhone SE采用电池元件无法直接用于iPhone 5s。
至于iPhone SE所采用1200万像素相机，同样因为模组设计与接点差异缘故，因此无法用在iPhone 5s上，但也因为接点差异缘故，因此iPhone SE所采用相机模组与iPhone 6s系列机种设计也无法直接互换使用。
而先前传出可能采用Intel LTE通讯模组的说法，在此次拆解内容中也证实仍采用Qualcomm提供元件，但仅采用旧款通讯模组，亦即与iPhone 5s相同设计，下载速度最高仅达LTE Advanced规格，亦即150Mbps。
